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WB实用工具——Swissprot数据库

发布时间:2024-08-05 11:27:00

戴格官网与UniProt建立链接

UniProt是Universal Protein 的英文缩写,是信息最丰富、资源最广的蛋白质数据库。它由整合Swiss-Prot、TrEMBL 和 PIR-PSD 三大数据库的数据而成。它的数据主要来自于基因组测序项目完成后,后续获得的蛋白质序列。它包含了大量来自文献的蛋白质的生物功能的信息。

上图是戴格生物官网某产品详情页截图,只需点击Swiss-Prot号即可跳转网站,获得UniProt上该蛋白的全部信息。

 

查找所选目标蛋白的分子量

①打开戴格官网——在搜索框中输入购买货号(如:db13524)——进入产品详情页后找到Swissprot号——进入页面后点击左栏“Sequence”,根据“Mass (Da)  42,009”可以得出,理论分子量约为42KD,那么在裁膜时根据marker位置留出足够的大小(为防止有PTMs,导致条带位置变化。)

②除了上述方式,购买戴格抗体都会附有说明书,说明书上会标注分子量,如果不慎丢失说明书,可以直接打开UniProt网站搜索目的蛋白,其他步骤如上所述。网址:https://www.uniprot.org/

 

多条带≠抗体不好

经常做WB的小伙伴知道有些靶标做出来总是带有两条甚至多条带,其实不是抗体或者实验方法的原因,而是因为有Isoforms的存在,那我们如何去辨别多条带?

例如:根据戴格官网上TF65_HUMAN(db13524)的Swissprot进入UniProt或在UniProt上搜索名称,在左侧栏点击“Sequence & Isoforms”可以看到有4个Isoforms存在,分别是约60kd、58.8kd、59kd、59.9kd。如果在目标细胞中表达的是其中任意2~4个isoforms,在做WB时就有可能出现2条带甚至4条带的现象。

 

细胞定位与UniProt

在做IHC/IF时,需要确定目标蛋白的细胞定位,以便观察,这个时候就可以用到UniProt精准定位。可以从戴格官网进入UniProt官网找到对应的蛋白,点击左侧栏“Subcellular Location”,可以看到TF65_HUMAN定位在细胞核上。

 

最后

以上便是关于戴格官网与UniProt网站的一些应用,戴格将会持续更新有关于科研的小知识,小技巧,让科研变得清晰便捷。

戴格生物提供大量一抗二抗、内参和标签抗体,覆盖病毒、细胞、外泌体、神经、表观等各个研究领域,帮助您的WB、ELISA、IHC、ICC/IF、IP等多个应用得到高质量结果助力科学研究!

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